MALDI-TOF Peptidmapping set-up

Proteinmengen die mittels Coomassie angefärbt werden können, reichen für die MALDI-TOF Analyse.

Die Proteinidentifikation mittels nano-ESI-MS/MS bietet im Vergleich zur Maldi-Tof Analytik die Möglichkeit sofort die Aminosäuresequenz von Peptiden aus dem tryptischen Verdau zu erhalten. Damit kann vermieten werden, dass nicht eindeutige Ergebnisse des Peptidmateches mittels Datenbankvergleich zu falschen Aussagen führen. Wir benötigen vom Kunden nur ein mit Coomassie gefärbtes Gelstückchen (am besten mit Foto des ganzen Geles) und einige Angaben über Größe des Proteins, etc.. Das Angebot umfasst die Probenvorbereitung (In-Gel Verdau mit Trypsin - Extraktion der Peptide - Entsalzung - Aufkonzentration der Probe), die ESI-MS Messung die die MS/MS-Messung 2'er ausgewählter Peptide (einer Mindestlänge von 6 Aminosäuren) und deren vollständige Sequezierung. Es folgt die Datenbankrecherche mit den erhaltenen Sequenzen. Die übermittlung der Daten beinhaltet eine ausführliche Dokumentation (Darstellung und Erklärung der Daten) mit Spektren, Auflistung der identifizieren Peptide/Proteine, sowie der Signifikanz der Ergebnisse. Für die Analytik werden mind. 2 pmol Protein benötigt.